Baltinavas vidusskolas skolēnu pašpārvaldes organizācija- Skolēnu padome darbojas atbilstoši reglamentam 9 cilvēku sastāvā. Skolēnu padomi ievēl katra mācību gada sākumā uz vienu gadu. Skolēnu padomes prezidentu un viņa vietnieku no sava vidus ievēl Skolēnu padomes locekļi.
Baltinavas vidusskolas Skolēnu padomes sastāvs 2024./2025. mācību gadā :
- Andris Astratovs (11.klase)- Skolēnu padomes prezidents
- Jēkabs Slišāns (8.klase)- Skolēnu padomes prezidenta vietnieks
- Markuss Skutelis (12. klase)
- Uldis Fogelis (9.klase)
- Egija Ļvova (9.klase)
- Madara Maksimova (6. klase)
- Emma Zelča (6.klase)
- Jānis Kārlis Boldāns (5.klase)
- Mariuss Siliņš (5.klase)